水分是中草藥生長發育的重要條件之一，水分不足，植物萎蔫，輕則減產，重則死亡；水分過多，莖葉陡長，延遲成熟，甚至使根系窒息而死，故排灌是種植中草藥不可忽視的關鍵環節。
(一)灌溉的一般原則 灌溉需要根據不同中草藥的習性區別對待，如甘草、麻黃等性喜干旱應少澆水；澤瀉、蓮等水生植物則不能缺水。通常一年生中草藥從播種到開花，需水量不斷增加，開花盛期后需水量開始減少。一般藥用植物苗期宜勤灌、淺灌，生長盛期應定期灌透水。花期對水分要求較嚴，過多常引起落花，過少則影響受精；果期在不造成落果的情況下，可適當偏濕；接近成熟期應停止灌水。夏季灌水，為減少土溫與水溫的差異，宜在早晚進行。鹽堿成分過高和有害廢水不能用于灌溉。
(二)灌溉方法 有溝灌、畦灌、淹灌、噴灌、滴灌、滲灌、皮管澆灌等，目前采用較多的是畦灌和溝灌。有條件的地方，應向噴灌和滴灌方向發展 ，用最少的水量獲得最高的產量。
(三)排澇 雨季來臨前要挖好排水溝，地下水位高、土壤潮濕，田間有積水時，應及時排出，以免爛根，甚至造成病害蔓延。
