河北農(nóng)業(yè)大學(xué)教授劉孟軍帶領(lǐng)其棗研究團(tuán)隊(duì)，通過(guò)與深圳華大基因科技有限公司等多家單位密切合作，在世界上率先完成了棗樹的全基因組測(cè)序。
棗樹原產(chǎn)于中國(guó)黃河中下游地區(qū)，是中國(guó)最古老的樹種之一。
棗樹原產(chǎn)于中國(guó)黃河中下游地區(qū)，是中國(guó)最古老的樹種之一。據(jù)化石和出土文物考證，棗樹在中國(guó)存在已超過(guò)1000萬(wàn)年。中國(guó)棗樹的栽培面積和產(chǎn)量均占到世界的99%，且棗樹已被引種到亞洲、非洲、美洲、歐洲和大洋州的40多個(gè)國(guó)家和地區(qū)。
基因組測(cè)序是打開生物學(xué)奧秘的金鑰匙，同時(shí)也是一項(xiàng)非常復(fù)雜的系統(tǒng)工程。2010年，河北農(nóng)業(yè)大學(xué)劉孟軍教授帶領(lǐng)其棗研究團(tuán)隊(duì)，在20多年棗樹科研積淀基礎(chǔ)上，開始了棗樹全基因組測(cè)序。
“在本項(xiàng)目啟動(dòng)前，有關(guān)棗基因組測(cè)序的基礎(chǔ)工作還非常薄弱，甚至連棗的基因組是多大都不知道。”劉孟軍告訴，“棗的基因組屬于高度復(fù)雜的類型，它的雜合度是當(dāng)時(shí)利用第二代測(cè)序技術(shù)植物中最高的，而且其重復(fù)序列比例偏高，GC含量偏低，使得其測(cè)序和組裝難度增大。”
劉孟軍說(shuō)，“我們?cè)诘诙鷾y(cè)序技術(shù)基礎(chǔ)上，采取了PCR-free和BAC-to-BAC等多種技術(shù)措施和方法，有效地克服了高度復(fù)雜棗基因組的測(cè)序、組裝以及填圖補(bǔ)洞等一道道難題，最終我們順利完成了我國(guó)著名棗品種'冬棗’的全基因組從頭測(cè)序，并且獲得了高質(zhì)量的棗基因組序列。
該研究項(xiàng)目共組裝出438M的序列，占預(yù)估棗基因組大小的98%。同時(shí)把80%的序列錨定到了棗的12條假染色體上，注釋出棗基因32000多個(gè)。這些基因的獲得為棗后續(xù)的功能基因組學(xué)研究提供了大量的基因資源，為揭示棗特殊生物學(xué)性狀的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
劉孟軍表示，棗全基因組測(cè)序的完成，標(biāo)志著中國(guó)在棗樹組學(xué)研究方面達(dá)到了國(guó)際領(lǐng)先水平，一舉跨入了世界果樹基因組學(xué)研究的俱樂(lè)部。該成果對(duì)推動(dòng)世界棗功能基因組學(xué)研究、促進(jìn)棗樹及其他果樹的遺傳改良和分子育種等將產(chǎn)生重大而深遠(yuǎn)的影響，具有重要的學(xué)術(shù)價(jià)值和潛在經(jīng)濟(jì)價(jià)值。
