機器使用一段時間后，水垢不可避免水，尤其缸蓋、缸體水套及水箱的水垢妨礙散熱，應及時清除。清洗冷卻系統的方法主要有：
1、堿洗法：其步驟為:
（1）啟動發動機 中速運轉讓水溫升到 50℃以上時熄火放盡冷卻水;
（2） 在 20公斤水中加1.5 公斤燒堿和 0.5 公斤煤油配制成清洗液 注入水箱;
（3） 啟動發動機中速運轉 5～10分鐘停車靜止10小時;
（4）再啟動發動機 控制油門令轉速時快時慢 使產生水流沖擊波讓水垢或沉淀物懸浮 運轉5～10分鐘后放盡清洗液;
（5）將清潔的軟水加入水箱 啟動發動機 中速運轉 5 分鐘后放盡清洗水重復 2～3 次。
2、酸洗法：將20%的鹽酸溶液注入水箱 停放 10 分鐘 放出清潔液再用清潔水沖洗凈。注意:配制鹽酸溶液時應將鹽酸慢慢倒入水中并不斷攪拌嚴禁將水倒入鹽酸中。無論酸洗、堿洗 對金屬皆有腐蝕性 因而須把握好清洗液的配比和清洗時間。
最后用清潔水多次沖洗。為避免冷卻系統被一般化學清洗液腐蝕也可采用專用“水箱清洗劑” 使用方法與上述堿洗法同。
