應安排在晴天，澆水后最好能有幾個連續晴天。一天中應選擇在上午，這不僅是水溫和地溫差別較小，地溫容易恢復，而且還有充分的時間來排除因澆水增加的空氣濕度。一般不宜選擇在中午，以免高溫時澆水影響根系生理機能。也不宜在傍晚和風雪天澆水，避免造成棚內地溫難恢復、濕度過大，引起蔬菜病害大發生。
溫室蔬菜水分嚴重不足時，植株萎蔫和葉片焦枯；水分過多時土壤缺氧引起根須腐爛，地上部分莖葉發黃甚至死亡。冬季溫室澆水溫度低，放風量小，水分消耗少，此時澆水后濕度變化較大，而且持續時間長，因此需小水勤澆。當棚內溫度比較低時，澆水次數盡量減少，量也要小，切忌大水漫灌，以防低溫高濕導致蔬菜漚根。冬季溫室澆水宜用地下井水直接灌溉，如果采用較冷的地面水灌溉，植株根系會受刺激，進而影響植株生長。平時澆水時要求水溫盡量與當時地溫相近。
澆水當天，為盡快恢復地溫，要密閉溫室，使棚室內的溫度迅速提高，以氣溫促地溫升高。地溫升高以后，再放風進行排濕，使溫度降低到適宜范圍。
