口蹄疫病毒屬于小核糖核酸病毒科的口蹄疫病毒屬，是一種單股正鏈RNA病毒。病毒呈球形，其直徑為20-30nm，不具有囊膜。是目前所知病毒中最細微的一級。其最大顆粒直徑為23納米，最小顆粒直徑為7--8納米。目前已知口蹄疫病毒在全世界有七個主型c A、O、C、南非1、南非2、南非3和亞洲1型，以及65個以上亞型。O型口蹄疫為全世界流行最廣的一個血清型，我國流行的口蹄疫主要為O、A、C三型及ZB型（云南保山型）。據觀察，一個地區的牛群經過有效的口蹄疫疫苗注射之后，1--2月內又會流行，這往往懷疑是另一型或亞型病毒所致。這是因為該病毒易發生變異。該病毒對外界環境的抵抗力很強，在冰凍情況下，血液及糞便中的病毒可存活120--170天。陽光直射下60分鐘即可殺死；加溫85℃15分鐘、煮沸3分鐘即可死亡。對酸堿之作用敏感，故1%一2%氫氧化鈉、30%熱草木灰、1%一2%甲醛等都是良好的消毒液。
