發現疑似口蹄疫病例后應立即采病料送檢，采料時,采樣人員應穿防護衣，戴口罩，防滲漏手套，膠鞋等安全防護措施。
檢驗樣品主要有：水皰皮或水皰液，O\P液（食道咽部刮取物），血液樣品等，也可檢驗動物的組織、臟器、分泌物、排泄物等。
采集的病料注明材料名稱，采集時間、地點、數量、送檢目的等事項，盡快送往指定的實驗室檢測。
我國科學家經過多年的努力，已經建立了許多口蹄疫的診斷方法，分別應用于病原分離鑒定和抗體檢測。
建立的補體結合試驗、液相阻斷酶聯免疫吸附試驗、聚合酶鏈反應、病毒中和試驗、病毒感染相關抗原瓊脂凝膠免疫擴散試驗等6項與國際技術接軌的口蹄疫診斷檢疫方法，打破了國外技術壁壘，在我國動物及動物產品的國際貿易中發揮了重要作用。
