菌棒上污染了綠霉是被綠霉菌感染造成的，可能是環境滅菌不徹底，管理不嚴密，溫度偏高，濕度大，通風不好造成的。
為了防止綠霉菌侵染，培養料滅菌要徹底。或在配制培養料時加入0.5%的多菌靈，以抑制綠霉菌的生長。在菌絲培養過程中，發現嚴重感染的菌袋需揀出，進行處理，帶出菇場深埋。感染不嚴重的菌棒，只有點式斑塊的仍可利用，但要與優質菌袋分開管理。香菇脫袋時或一、二潮菇出菇初期出現綠霉菌，可用0.2%多菌靈或0.2%代鋅或5%石灰水噴灑被害部位，防止擴散。出菇中后期出現綠霉菌，采菇后曬棚可抑制綠霉生長。如果綠霉菌污染面積太大，就不能被救了，應及時處理，否則會影響其他菌棒。
總之，要防止綠霉菌感染，做到徹底清潔，培養料滅菌徹底，菇房滅菌好，管理嚴密，對多年種植的場地，更要注重消毒工作，否則會出現一年好，二年感染輕，三年感染重，四年、五年一敗涂地的現象。
