草菇菌種無論是自己分離的或是引進的，都必須經過出菇試驗，在確認是高產、優質的菇種后方可擴大培養，以免造成經濟損失。合格的菌種質量要求（供參考）：
①菌絲淡黃色、透明，厚垣孢子較多或無（因品種的不同而表現不一），全瓶菌絲分布均勻，培養基含水量適宜（65%左右）。
②菌種菌齡適宜，新鮮、健壯，生長勢強。
③無雜菌、無蟲害。
凡有以下情況之一者為不合格的菌種：
①菌絲白色透明，無厚垣孢子或很少，屬幼齡菌種，須繼續培養到適齡期方可使用。
②菌絲逐漸稀少，但有大量厚垣孢子充滿料內，菌絲黃色、濃密如菌被，上層菌絲萎縮，屬老齡菌種，對產量影響較大，不宜使用。
③菌絲稀疏、透明，纖細如蜘蛛絲樣，說明菌絲吸收營養不足，菌絲分枝少，常見于培養料滅菌不徹底，草料表面有大量枯草桿菌繁殖，影響草菇菌絲吸收營養所致，這樣的菌種也不宜使用。
④菌絲逐漸消亡，袋壁蒙上一層會爬動的粉末，是害蟲螨類在蛀食菌絲，應予淘汰。
⑤菌種袋沉重，菌絲生長不旺，厚垣孢子堆成團塊，系培養料濕度太大所致，菌種質量不好。
⑥菌絲密集，顏色潔白，有時有小菌核，可能混有雜菌，若瓶內長出墨汁狀傘菌，證明已感染鬼傘菌，應予淘汰。
①菌絲淡黃色、透明，厚垣孢子較多或無（因品種的不同而表現不一），全瓶菌絲分布均勻，培養基含水量適宜（65%左右）。
②菌種菌齡適宜，新鮮、健壯，生長勢強。
③無雜菌、無蟲害。
凡有以下情況之一者為不合格的菌種：
①菌絲白色透明，無厚垣孢子或很少，屬幼齡菌種，須繼續培養到適齡期方可使用。
②菌絲逐漸稀少，但有大量厚垣孢子充滿料內，菌絲黃色、濃密如菌被，上層菌絲萎縮，屬老齡菌種，對產量影響較大，不宜使用。
③菌絲稀疏、透明，纖細如蜘蛛絲樣，說明菌絲吸收營養不足，菌絲分枝少，常見于培養料滅菌不徹底，草料表面有大量枯草桿菌繁殖，影響草菇菌絲吸收營養所致，這樣的菌種也不宜使用。
④菌絲逐漸消亡，袋壁蒙上一層會爬動的粉末，是害蟲螨類在蛀食菌絲，應予淘汰。
⑤菌種袋沉重，菌絲生長不旺，厚垣孢子堆成團塊，系培養料濕度太大所致，菌種質量不好。
⑥菌絲密集，顏色潔白，有時有小菌核，可能混有雜菌，若瓶內長出墨汁狀傘菌，證明已感染鬼傘菌，應予淘汰。
