我國農藥產業發展了這么多年久，在農藥創制中仍存在一些問題。這里總結了農藥創制的一些問題，希望農藥產業能更好的發展。
農藥創制問題分析，望農藥產業邁上新臺階。
首先是農藥創新體系和創新理論與方法中存在問題。研發體系包括合成、生測、工藝、制劑、安全評價、市場評估、登記、全球營銷網絡，我國雖然有不少單位從事新農藥創制，但創新體系不完善或者不健全，大多數單位僅僅有合成，有的單位甚至連生測也沒有，即使有生測，靶標也不一定以市場為導向。理論方法差別不大，主要是因為經費等資源有限造成的理論創新受限。此外在創新方法上也不是以市場以靶標為導向，也存在為了創制而創制的現象。
其次，農藥創新機構間協作中存在問題。眾所周知，產品再好，也必須通過一定的推廣與營銷才能帶來實際收益，但目前推廣應用實力強的單位通常創新能力有限，而創新能力強的單位，市場能力又有欠缺。兩者缺乏合作，導致推廣難度加大。此外，盡管有些機構間合作良好，但由于缺乏產業化的平臺，所以產業化難以實現。
再次，農藥知識產權保護與轉化中存在問題。我國專利法從1985年開始施行至今僅僅只有30多年，雖然人們對知識產權的重視程度正在提高，但總體重視程度還不夠高。同時，企業研發經費不足、農藥創制周期長，再加上農藥市場已近飽和，所以更多的企業還是選擇能夠快速帶來經濟效益的仿制農藥。再有，某些產品盡管能夠成功開發和申請專利，但因其性價比有限而成為雞肋產品，所以從事創新的企業寥寥無幾。
最后，中國農藥在實踐應用中存在問題。有些農藥使用者在實際操作時缺乏專業知識與技術，不當的操作導致病蟲草害的抗性增加。同時，很多使用者缺乏預防為主的理念，使得防治效果不佳。
