近年來，山東微山縣結合各鄉鎮養殖特點，通盤考慮產業基礎、畜牧資源、糞污處理和生態保護，穩規模、提效率、保生態，合理調整安排畜禽養殖用地，科學劃定畜禽養殖禁養區、限養區、適養區，合理確定養殖品種、規模和總量，優化生態畜牧業布局，加強分類指導，有效促進了規范化生態畜牧養殖業發展。
一是科學制定畜牧業養殖規劃，發展生態健康畜牧業。制訂了《微山縣畜禽養殖區域布局規劃》，規劃打造了肉蛋鴨養殖區、麻鴨生態養殖區、生豬養殖區、蛋雞養殖區、特種動物養殖區等一批特色畜牧業專業區域。二是加強對養殖場區設計改造。對新上養殖場一律配套糞污無害化處理設施，達到標準化養殖場建設要求；引導資金、技術實力比較強的規模養殖場戶進行畜禽養殖垃圾處置的配套化、規范化改造，發展生態畜產品和商品有機肥生產，發展循環產業，促進提質增效。三是依托項目建設，加快畜牧業生態健康養殖進程。積極做好省市標準化建設項目，畜牧業標準化、品牌化進程不斷加快。2014年以來實施了8處畜禽養殖廢棄物無害化處理示范工程項目，對19處養殖場通過推廣雨污分離、病死畜禽及糞污無害化處理綜合利用技術減少污染排放，改造升級養殖場8處，新建高標準養殖場7處，新增規模養殖戶13戶，全部達到標準化養殖場生態健康養殖要求，全縣規模養殖比重達到80%以上。四是深入推進南水北調沿線畜禽養殖污染治理工作。按照實施方案和治理方案要求，全面取締河道畜禽養殖，以及河道大堤外兩側1公里范圍內畜禽養殖場治理改造，完成了南水北調核心區及河道大堤內151家畜禽養殖場（戶）關閉清理及畜禽處置工作、南水北調核心區及河道大堤外兩側1公里范圍內232處畜禽養殖場（戶）治理改造。同時大力推廣現代化養殖新模式，積極開展了“退村進區”工程，實行相對封閉、統一管理，逐步實現畜禽養殖垃圾處置的配套化、規范化。
