我國地大物博，幅員廣闊，適合育種制種農田的分布地有很大不同，因此企業在進行土地流轉規模化制種時，就需要因地制宜。
中國種子集團在甘肅省張掖市甘州區通過“反租包干”的模式流轉了近1萬畝制種田，土地集中流轉后，承包給當地89個制種大戶，同時聘請示范基地的農戶從事田間作業，讓農民流轉土地后依然“有事干、有錢賺”，這樣既有效解決了種業生產的隔離區問題，保障了種子的生產質量，同時還有利于減少私留種子、套購種子等現象的發生。北京奧瑞金種業股份有限公司同樣在甘肅省臨澤縣流轉了1.8萬畝制種田，他們采用了農場式的管理方式，從村委會入手，由村干部牽頭組織農戶進行土地流轉。在四川等田塊分散的地區，很多種企呼吁國家出臺相應鼓勵政策，引導有經濟能力的農戶因地制宜地開展濕度規模經營，中種集團在四川省眉山地區也流轉土地并開展了規?；品N嘗試。
通過土地流轉實現規模化經營是發展現代種業的必然要求，更是現代種業未來發展大趨勢。但現實是，全國的制種基地和制種田或多或少都在萎縮。中國種子集團副總經理田冰川談到制種基地土地流轉問題時說：“就目前情況來說，由于國內種企規模相對較小，品種單一，承擔風險能力相對較弱，種企開展土地流轉、規模化經營依然面臨著巨大的風險和困難。”
面對行業競爭，國內種企應該強化科技支撐，在優化用工和管理方式的同時，探索新型制種經營體系。此外，相應的種業保險也應不斷完善，以提高國內種企的抗風險能力。“國家可以通過區域規劃的方式，制定制種基地保護區，從源頭確保糧食生產用種的質和量。”北京奧瑞金種業股份有限公司總經理劉一政說，“對于保護區內的農民可以根據情況給予制種補貼，以調動其制種積極性。”
全國各地的制種基地，雖然在地域上分布比較廣，但是在管理上應該全國上下“一盤棋”，切忌“各自為戰”，應做到統籌兼顧。只有全國制種基地統一起來，站在戰略高度進行宏觀把控才能更好地保證種業的發展，從源頭上解決問題打破地方保護主義。各地應因地制宜制定相關政策法規進行輔助，這樣一來，全國的制種基地就可以擰成一股繩，為民族種業推波助瀾。應該看到，國家級制種基地是為了保證全國范圍的用種安全而設立的，這些基地應該受到國家政策的支持和幫助。而很多地方也存在著為地方供種的小規模制種基地，為了農業用種安全，各地也應出臺一些地方性政策以保護制種基地。
目前，很多用種大省自身不具備制種能力或制種量不能自給自足，這樣一來，種子在流通過程中很容易出現問題。因此，加強基地建設，還必須建立基地管理與市場監管聯動機制，讓好基地生產出的好種子能順利到達農民手中。
