近年來，亳州市大力實施“以藥立市、以藥興市”的發展戰略，著力打造現代中藥加工業、種植業規模達1000億元、商貿流通及電子商務規模達1000億元的“雙千億元”藥業產業，努力建設現代“中華藥都”。目前，該市的的中藥產業已經發展成為包括中藥材種植、中藥工業、中藥商貿流通、中藥科研、教育和中藥文化傳播交流等比較完整的中藥產業體系。
中藥材種植穩定發展。全市中藥材種植在地面積108萬畝，產值30多億元，并且建立現代農業綜合開發中藥材示范區，以及一批中藥材良好農業規范生產基地，規范化種植進一步發展。
醫藥工業迅速發展。2014年新增藥業工業企業28家，其中已經取得GMP認證的企業15家，全市通過GMP認證藥業企業達到102家，規上藥業工業產值193.18億元，同比增加17.7%，工業增加值48.6億元，同比增長15.8%，占全市規上工業增加值21.7%。中藥飲片加工集聚發展，已形成全國最大的中藥飲片產業集群，生產的飲片品種囊括普通飲片、毒性飲片、精加工精包裝飲片、小包裝飲片、直接口服飲片等各種類型。
中藥商貿繁榮發展。亳州中藥材專業市場是國內第一藥市上市品種最多、交易最為活躍的中藥材專業交易市場，2010年康美藥業接管中藥材專業市場，實行公司化改制，進一步建立健全市場管理體制。2014年，中藥材專業市場上市品種2600多個，日客流量3萬余人，營業額約212億元。中藥對外貿易不斷擴大，全市藥業行業進出口總額1.74億美元，榮獲“國家外貿轉型升級醫藥專業型示范基地”、“中國中藥飲片出口基地”，“全國中藥飲片出口城際第一名”。中藥材商貿平臺不斷豐富，中藥材商品交易中心掛牌成立，中藥材金融商業試點、中藥流通市場創新試點穩步推進，建成藥通網、康美中藥材網、藥博商城、東方中藥材網等多家中藥信息商務網站，藥通網被商務部認定為“首批中藥材電子商務示范平臺”。
據了解，自2003年以來，每年農歷正月均由北京同仁堂為中國亳州藥市開市，使中斷百年的“同仁堂不到不開市”的傳統得以在亳州延續和傳承和發展。北京同仁堂是中藥行業著名的老字號，在歷史上久負盛名，享譽海內外。十多年來，藥市開市活動突出“和諧藥都·魅力藥市”主題，進一步弘揚了中醫藥文化，提升了市場品位、凝聚了藥市人氣，推進了藥業經濟健康、快速、可持續發展。
